Au moment où son ami et colocataire Marshall demande son amie Lily en mariage, Ted Mosby sent sa vie basculer. Lui-aussi décide de se mettre à la recherche de sa future épouse et ce, malgré les mises en garde de Barney qui lui déconseille de songer au mariage avant d'avoir atteint la trentaine. Très vite, Ted rencontre au Mac Laren’s une splendide jeune femme dont il tombe aussitôt amoureux, la journaliste Robin Scherbatsky. Les deux jeunes gens ont un premier rendez-vous qui se passe merveilleusement bien et le soir Ted se présente à l'appartement de celle qu'il voit déjà comme sa future fiancée. Mais il commet alors une terrible erreur en disant à Robin qu'il l'aime, déclaration qu’elle juge largement prématurée, demandant du coup à son soupirant de rentrer chez lui. Abattu, Ted finit par se faire à l'idée qu'il ne la reverra jamais, mais c’est sans compter sur le fait que Robin est devenue une habituée du Mac Laren’s où elle s’est vite liée d’amitié avec Lily et Marshall. Elle avoue d’ailleurs à Lily qu’elle ne souhaite que des relations occasionnelles, ce qui lui interdit de céder à Ted qui recherche quelque chose de beaucoup plus sérieux. Déterminé à ne pas abandonner, Ted invite Robin à trois fêtes successives et l'amène sur le toit de son immeuble. Là, il lui promet qu'il pourra accepter une relation moins sérieuse mais après avoir embrassé Robin il réalise que ses sentiments sont toujours aussi forts et qu'il serait donc une erreur de se mettre ensemble. Les deux jeunes gens décident alors de rester amis.

Par la suite Ted, soucieux de surmonter sa déception, entreprend de multiples tentatives pour rencontrer une autre femme. Son ami Barney l'épaule de manière active, même si ses méthodes ne sont pas toujours du goût du romantique architecte. Ted tente entre autres sa chance dans une agence de rencontre, il veut croire en sa destinée commune avec une fille qu’il a rencontrée quatre ans plus tôt lors d’une fête de Halloween et songe également à reprendre contact avec ses anciennes conquêtes avant de se saouler pour vivre une nuit exceptionnelle. Mais malheureusement pour lui, toutes ces tentatives se soldent par des échecs et il n'avance guère dans sa course au grand amour. Pendant ce temps, Robin a plusieurs petits amis éphémères parmi lesquels un gentil garçon du nom de Mike et un millionnaire appelé Derreck. Mais l'enthousiasme de la journaliste reste toujours modéré et ses ruptures successives ne semblent pas l'affecter outre mesure.
De leur côté, Lily et Marshall, après s’être fiancés, sont obligés de faire face à leur avenir. Il est temps pour eux de se comporter en adultes et de régler des questions essentielles : où devront grandir leurs enfants ? Qui de Ted ou de Marshall gardera l'appartement après le mariage ?

Enfin, le soir du 31 décembre 2005, Ted invite ses amis à faire le tour de New York en limousine. Il convie également une fille dont il pense qu'elle est attirée par lui, mais celle-ci comprend bien vite qu’en réalité Ted n'a d'yeux que pour Robin. Elle lui révèle d’ailleurs que l‘apparente indifférence de la journaliste est feinte. En effet, Robin promet à Ted de l'embrasser à minuit, ce qui se produit, faisant renaître l'espoir dans le cœur du jeune homme.

Déterminé à tenter de nouveau sa chance, Ted invite Robin à l'accompagner au mariage de ses amis Claudia et Stuart. Elle accepte mais à la dernière minute elle est retenue à son travail. Déprimé, Ted se rend donc seul à la cérémonie où il fait cependant la connaissance de Victoria avec laquelle il passe une soirée magique. Enthousiasmé, il décide de revoir la jeune femme qui devient bien vite sa nouvelle petite amie. Cette évolution n'est pas du tout du goût de Robin qui doit successivement avouer à Lily et à Barney ses sentiments pour Ted.

L'entente entre Ted et Victoria semble parfaite au moment où la jeune femme se voit offrir la chance de s’inscrire à une école de pâtisserie en Allemagne. Ted tente d’abord de la retenir mais la laisse finalement partir, bien décidé à poursuivre une relation à distance. Malheureusement, celle-ci se révèle bien vite difficile et Ted finit par se convaincre que leur rupture n'est plus qu'une question de temps. C’est alors que Robin prend l'initiative d'inviter le jeune homme chez elle en pleine nuit. Malgré ses hésitations, Ted décide de se rendre chez elle mais au moment où ils s'apprêtent à passer la nuit ensemble Victoria appelle. Robin, qui pensait qu'ils avaient rompu, est furieuse contre Ted et lui dit de partir.

Pendant tout ce temps, les projets de mariage de Marshall et Lily se précisent, les deux jeunes fiancés doivent se mettre d'accord sur les détails de leur cérémonie, ce qui n'est pas toujours facile. Barney profite du trouble qui s'empare de Marshall pour lui faire comprendre que le salaire d'un avocat écologiste ne sera pas suffisant pour rendre Lily heureuse, il lui propose donc de travailler avec lui chez Ultracell. Marshall refuse dans un premier temps mais il est obligé d'accepter lorsque Lily détruit accidentellement une robe de mariée très coûteuse lors d'un essayage. Pour Marshall commence alors une nouvelle carrière, soi-disant provisoire, dans le département juridique d’Ultracell, ce qui n'est pas du tout du goût de sa fiancée.
La relation entre Ted et Robin est quelque peu tendue, les deux jeunes gens essaient mutuellement de se rendre jaloux et la journaliste fait mine de céder aux avances répétées de son collègue Sandy Rivers.
Entre temps, plus son mariage approche, plus Lily est rongée par le doute. Elle se rappelle ses rêves de jeunesse et constate qu'elle n'en a réalisé aucun. Troublée, elle envoie une candidature pour participer à une communauté artistique de trois mois à San Francisco. Lorsque Marshall l'apprend, il est choqué, l'idée de repousser le mariage lui déplaît fortement. Leur couple entre alors dans une crise, Lily va-t-elle ou non partir pour la Californie et mettre ainsi leur relation en danger ?

De son côté, Ted est à bout de nerfs car il croit que Robin va réellement sortir avec Sandy. Il tente alors le tout pour le tout en surprenant la jeune femme dans son appartement accompagné d'un orchestre de cordes, mais elle n'est toujours pas prête à s'engager. Ted décide donc que seuls des moyens surnaturels pourront lui permettre de conquérir enfin son grand amour : pour éviter que Robin ne parte en camping avec Sandy, il fait appel aux vieux esprits amérindiens afin de provoquer la pluie. Une terrible averse oblige en effet Robin à annuler sa sortie et Ted en profite pour se rendre chez elle. Cette fois, elle ne le repousse plus et ils finissent par se mettre ensemble après un long baiser... Mais en rentrant chez lui ce soir là, Ted doit constater qu'il n’est pas le seul pour qui cette nuit a tout changé : Marshall et Lily ont rompu leurs fiançailles…